Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms