Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHDQ02161 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHDQ02161 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHDQ02161 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHDQ02161 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms