Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPCQ01831 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPCQ01831 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPCQ01831 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPCQ01831 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPCQ01831 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
XPCQ01831 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
XPCQ01831 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
XPCQ01831 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms