Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MC1RQ01726 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms