Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM1P81133 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIM1P81133 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIM1P81133 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms