Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX1P78414 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRX1P78414 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms