Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms