Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms