Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS16P62249 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS16P62249 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS16P62249 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS16P62249 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS16P62249 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS16P62249 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS16P62249 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS16P62249 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS16P62249 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS16P62249 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS16P62249 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS16P62249 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms