Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms