Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms