Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms