Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms