Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms