Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms