Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms