Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK8P49336 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK8P49336 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms