Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms