Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTRNP46939 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UTRNP46939 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTRNP46939 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UTRNP46939 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UTRNP46939 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTRNP46939 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms