Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XCR1P46094 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XCR1P46094 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XCR1P46094 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XCR1P46094 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms