Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GJC1P36383 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GJC1P36383 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GJC1P36383 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GJC1P36383 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GJC1P36383 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GJC1P36383 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GJC1P36383 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GJC1P36383 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GJC1P36383 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GJC1P36383 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GJC1P36383 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GJC1P36383 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GJC1P36383 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GJC1P36383 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GJC1P36383 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GJC1P36383 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GJC1P36383 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GJC1P36383 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms