Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms