Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP6P35125 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP6P35125 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP6P35125 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP6P35125 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms