Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRS3P32247 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRS3P32247 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms