Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKBRP32239 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms