Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA9P31269 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms