Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRMP28827 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms