Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PEX2P28328 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PEX2P28328 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms