Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms