Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
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