Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERBB3P21860 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms