Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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