Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms