Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSP16219 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSP16219 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSP16219 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSP16219 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSP16219 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSP16219 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSP16219 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSP16219 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSP16219 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSP16219 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSP16219 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSP16219 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSP16219 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSP16219 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSP16219 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms