Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME1P15531 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME1P15531 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NME1P15531 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms