Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP3P12645 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP3P12645 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms