Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTHFD1P11586 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTHFD1P11586 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms