Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLK3P07288 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLK3P07288 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLK3P07288 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLK3P07288 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLK3P07288 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLK3P07288 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLK3P07288 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLK3P07288 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLK3P07288 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms