Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGHG1P01857 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IGHG1P01857 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms