Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX58O95786 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX58O95786 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX58O95786 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX58O95786 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX58O95786 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX58O95786 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX58O95786 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX58O95786 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms