Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRATO95237 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRATO95237 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRATO95237 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LRATO95237 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRATO95237 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRATO95237 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRATO95237 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRATO95237 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRATO95237 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRATO95237 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRATO95237 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRATO95237 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms