Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA4O75335 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA4O75335 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms