Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms