Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TIMM17BO60830 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms