Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX5O60225 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX5O60225 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX5O60225 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX5O60225 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX5O60225 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX5O60225 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX5O60225 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX5O60225 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX5O60225 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX5O60225 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX5O60225 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms