Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms