Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TLX3O43711 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TLX3O43711 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TLX3O43711 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLX3O43711 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLX3O43711 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLX3O43711 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms