Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DENRO43583 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DENRO43583 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DENRO43583 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms