Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA3O43365 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA3O43365 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA3O43365 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA3O43365 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA3O43365 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA3O43365 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms