Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB1O43157 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB1O43157 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms